More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2214 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  77.29 
 
 		 258 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  54.98 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.44 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  51.79 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.56 
 
 		 279 aa  268  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  52.96 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 		 259 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  54.3 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  51.39 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.37 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  50.79 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.37 
 
 		 258 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.94 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.57 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  52.33 
 
 		 281 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  50.6 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  53.17 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.39 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  48.82 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  49.61 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  49.61 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  51.61 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  48.43 
 
 		 263 aa  245  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.62 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.62 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  49.61 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  46.3 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.18 
 
 		 264 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.85 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.39 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 		 283 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  38.93 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  43.36 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.54 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.77 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  40.25 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.76 
 
 		 292 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.83 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.1 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.8 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.41 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  41.04 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  38.82 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.34 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.97 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.24 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.85 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.98 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.98 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.45 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 249 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.43 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  40.08 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  37.86 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.62 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.72 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.35 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  43.46 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  39 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.92 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.8 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  41.28 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.92 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.9 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.39 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.92 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.08 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000170517  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  38.14 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  39.92 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  37.02 
 
 		 225 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.51 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.51 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>