More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
262 aa  527  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.27 
 
 
279 aa  332  5e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.75 
 
 
258 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.32 
 
 
251 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  61.75 
 
 
253 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  62.3 
 
 
259 aa  314  9e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  62.4 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  60.56 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  62.75 
 
 
253 aa  304  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  61.2 
 
 
253 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  62.75 
 
 
253 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
255 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.29 
 
 
254 aa  294  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  58.5 
 
 
255 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  56.64 
 
 
257 aa  291  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  60.56 
 
 
259 aa  288  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.44 
 
 
257 aa  285  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  57.31 
 
 
256 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  56.57 
 
 
253 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
256 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
259 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.63 
 
 
253 aa  268  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 
257 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56 
 
 
259 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  54.72 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  52.55 
 
 
258 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.57 
 
 
259 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  54.86 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.23 
 
 
252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 
263 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  52.67 
 
 
281 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.57 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  52.34 
 
 
262 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.88 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.88 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  47.22 
 
 
278 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.36 
 
 
246 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  45.63 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.25 
 
 
258 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  49.21 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.94 
 
 
263 aa  218  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.4 
 
 
264 aa  215  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40 
 
 
264 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  40.4 
 
 
264 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
263 aa  202  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  41.31 
 
 
268 aa  198  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  38.8 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  40.39 
 
 
340 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.34 
 
 
249 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  43.59 
 
 
241 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.44 
 
 
282 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.02 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.56 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.65 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 
246 aa  181  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 
266 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  41.22 
 
 
264 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.68 
 
 
247 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  40.34 
 
 
276 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  42.74 
 
 
236 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.34 
 
 
233 aa  180  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  42.31 
 
 
247 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.65 
 
 
282 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.1 
 
 
255 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 
232 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.92 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  38.24 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.63 
 
 
258 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  43.16 
 
 
236 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 
233 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  39.53 
 
 
304 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  37.83 
 
 
289 aa  175  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 
247 aa  175  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.13 
 
 
252 aa  175  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.15 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  36.78 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.52 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  39.11 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.67 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.59 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.14 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  37.3 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.08 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.67 
 
 
249 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.11 
 
 
249 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.25 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.93 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.74 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  34.03 
 
 
248 aa  171  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.39 
 
 
246 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  35.62 
 
 
228 aa  171  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.42 
 
 
258 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 
231 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
252 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  37.18 
 
 
285 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>