More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0732 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  69.92 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  69.53 
 
 		 256 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  65.48 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  62.5 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  60.47 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.57 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  58.43 
 
 		 255 aa  304  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  59.53 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  59.61 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.84 
 
 		 258 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  57.71 
 
 		 259 aa  294  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.5 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.52 
 
 		 262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.12 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  51.55 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  54.23 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.9 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.99 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  56.13 
 
 		 259 aa  268  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  56.08 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  54.62 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  53.54 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  49.22 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 		 265 aa  242  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.39 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  49.2 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  48.24 
 
 		 262 aa  234  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.95 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.95 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  47.24 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  44.36 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4137  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.77 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  42.69 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.97 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  41.34 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.74 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  38.74 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.32 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  39.37 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3752  Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.44 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  41.73 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  38.11 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.07 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.51 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.65 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.28 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.98 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  37.86 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.08 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.96 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  41.06 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.39 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.63 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.63 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  39.66 
 
 		 276 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  37.66 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.87 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  41.42 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  42.13 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  39.83 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  38.71 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  41.6 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.8 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.32 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.75 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.25 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  40.82 
 
 		 249 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  37.29 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.18 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.92 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  39.06 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  42.62 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.55 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  39.32 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  39.09 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.51 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 273 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>