More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3073 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
329 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.13 
 
 
301 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 
291 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.12 
 
 
303 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.85 
 
 
303 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.5 
 
 
290 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.15 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  36.1 
 
 
312 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.74 
 
 
339 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1717  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.33 
 
 
290 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.1 
 
 
312 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.46 
 
 
312 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
348 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  32.98 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.96 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  33.67 
 
 
475 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  31.91 
 
 
473 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1031  PDZ/DHR/GLGF  30.9 
 
 
290 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  33.09 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3766  Serine protease  33.81 
 
 
288 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  28.76 
 
 
318 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  32.27 
 
 
509 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1880  PDZ/DHR/GLGF  30.67 
 
 
290 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.2 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  33.58 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  31.03 
 
 
498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  33.46 
 
 
467 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  30.77 
 
 
487 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  32.44 
 
 
516 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  32.61 
 
 
523 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  29.37 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  32.08 
 
 
477 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.16 
 
 
476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  31.94 
 
 
464 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 
477 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 
477 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  32.33 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.95 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  32.6 
 
 
471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  32.81 
 
 
485 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  30.83 
 
 
490 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  30.83 
 
 
476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  32 
 
 
487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  32.12 
 
 
522 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  32.17 
 
 
511 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  32.75 
 
 
488 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  31.27 
 
 
505 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  28.57 
 
 
493 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  32.7 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  28.19 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32.06 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.32 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  30.99 
 
 
464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  30.25 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  29.89 
 
 
500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  29.89 
 
 
490 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  32.41 
 
 
485 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  30.25 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  30.63 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  30.25 
 
 
498 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  31.46 
 
 
503 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  32.06 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  31.84 
 
 
503 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  32.69 
 
 
479 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  31.09 
 
 
493 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  29.89 
 
 
499 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  29.93 
 
 
473 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  29.02 
 
 
474 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  31.51 
 
 
347 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  30.68 
 
 
476 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.71 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  29.2 
 
 
383 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  30.43 
 
 
481 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  32.71 
 
 
483 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  32.71 
 
 
483 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  29.89 
 
 
499 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 
398 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  31.08 
 
 
487 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  30.2 
 
 
465 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  31.58 
 
 
398 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  29.31 
 
 
471 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  29.12 
 
 
588 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.94 
 
 
474 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  32.71 
 
 
471 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  28.11 
 
 
491 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  31.34 
 
 
524 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  32.34 
 
 
483 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  31.85 
 
 
514 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  31.34 
 
 
524 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  30.8 
 
 
401 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  30.08 
 
 
408 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  32.58 
 
 
478 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 
401 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  32.93 
 
 
323 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  31.94 
 
 
474 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  31.7 
 
 
491 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  31.5 
 
 
472 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  29.7 
 
 
485 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  28.52 
 
 
475 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  29.7 
 
 
408 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>