More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0797 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  88.45 
 
 		 303 aa  512  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.2 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  46.91 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  38.85 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.59 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  40.58 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.67 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.67 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.59 
 
 		 484 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.01 
 
 		 513 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.99 
 
 		 464 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.79 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.79 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  35.96 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  35.2 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  36.43 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  36.4 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.05 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  36.9 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  36.9 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  34.25 
 
 		 478 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  36.9 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.27 
 
 		 450 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.27 
 
 		 450 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.27 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  35.21 
 
 		 456 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.77 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  35.16 
 
 		 464 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.9 
 
 		 450 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  36.16 
 
 		 462 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.8 
 
 		 398 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  36.13 
 
 		 457 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  36.88 
 
 		 460 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  36.53 
 
 		 450 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.67 
 
 		 449 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  36.67 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  36.16 
 
 		 449 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  36.67 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  35.36 
 
 		 511 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  36.06 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  34.64 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  35 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  34.64 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  32.85 
 
 		 466 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  34.64 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  34.64 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  34.64 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  34.64 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.08 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.08 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  34.64 
 
 		 402 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  34.83 
 
 		 463 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  35.93 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  34.07 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.55 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  37.27 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  33.33 
 
 		 462 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  36.82 
 
 		 518 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  34.07 
 
 		 455 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  34.07 
 
 		 455 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  34.83 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.9 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.02 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  34.07 
 
 		 455 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  37.69 
 
 		 456 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  33.93 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  34.83 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  34.07 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  33.93 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  34.32 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  33.71 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  31.8 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  34.29 
 
 		 388 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  35.19 
 
 		 451 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  34.08 
 
 		 528 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.1 
 
 		 396 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  34.08 
 
 		 527 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  36.16 
 
 		 450 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  37.87 
 
 		 385 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.48 
 
 		 485 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.03 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  34.46 
 
 		 455 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  37.69 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  35.79 
 
 		 450 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  33.21 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  33.21 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>