More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1230 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  88.45 
 
 		 303 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  50.86 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.12 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  39.12 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.23 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  39.13 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.38 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.38 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  34.19 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  36.66 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.09 
 
 		 513 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  34.97 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.69 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.63 
 
 		 464 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.32 
 
 		 484 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  35.69 
 
 		 442 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  33.95 
 
 		 462 aa  138  8.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36 
 
 		 478 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.82 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  32.66 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  33.21 
 
 		 466 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  34.83 
 
 		 471 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  35.44 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1495  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.59 
 
 		 381 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  35.44 
 
 		 460 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  35.48 
 
 		 465 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  32.84 
 
 		 466 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  38.6 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  34.69 
 
 		 456 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 401 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  34.67 
 
 		 449 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  34.74 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  32.12 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  34.86 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  34.91 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  35 
 
 		 511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  35.04 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  37.81 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.07 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.07 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  35.44 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  34.74 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.74 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  34.91 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  35.04 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  35.04 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  34.91 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.74 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.59 
 
 		 383 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  35.94 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  34.67 
 
 		 450 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  36.26 
 
 		 485 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  38.29 
 
 		 450 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  33.33 
 
 		 500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  33.95 
 
 		 451 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  34.92 
 
 		 341 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  33.33 
 
 		 527 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  32.14 
 
 		 471 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  35.53 
 
 		 456 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  34.74 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  34.44 
 
 		 535 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  35.09 
 
 		 387 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  34.74 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  36.5 
 
 		 481 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  34.52 
 
 		 466 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  35.02 
 
 		 462 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  33.22 
 
 		 473 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.64 
 
 		 479 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  33.71 
 
 		 457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  33.71 
 
 		 457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.79 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.53 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.63 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  33.58 
 
 		 463 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  34.55 
 
 		 450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.38 
 
 		 473 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  33.82 
 
 		 459 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  32.84 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  35.25 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  34.74 
 
 		 402 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  34.74 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  34.74 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  34.74 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 		 384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  35.13 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.46 
 
 		 464 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.53 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  34.16 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  35.09 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.97 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.95 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  35.13 
 
 		 493 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.66 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  32.36 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  33.94 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>