More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1717 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1717  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  540  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  79.66 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3766  Serine protease  58.58 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1880  PDZ/DHR/GLGF  45.67 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1031  PDZ/DHR/GLGF  44.14 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  36.82 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.03 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.19 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.25 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  38.41 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.25 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  33.68 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.67 
 
 		 537 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.25 
 
 		 464 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.1 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.77 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  31.46 
 
 		 528 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.09 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  28.48 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.66 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  32.22 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  27.53 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  30.6 
 
 		 527 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.25 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  31.87 
 
 		 476 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  29.96 
 
 		 528 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  29.21 
 
 		 523 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  31.23 
 
 		 483 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  29.41 
 
 		 497 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.21 
 
 		 516 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  30.51 
 
 		 491 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.88 
 
 		 338 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  29.9 
 
 		 501 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  30.84 
 
 		 361 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.87 
 
 		 513 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.8 
 
 		 502 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  32.22 
 
 		 479 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.11 
 
 		 483 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.11 
 
 		 483 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  33.09 
 
 		 473 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  31.19 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  30.74 
 
 		 479 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  31.14 
 
 		 476 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  31.85 
 
 		 481 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  29.21 
 
 		 520 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  30.03 
 
 		 500 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  32.5 
 
 		 517 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  28.94 
 
 		 508 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  32.17 
 
 		 520 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  31.39 
 
 		 513 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  31.39 
 
 		 513 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  31.14 
 
 		 508 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  31.65 
 
 		 485 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  26.97 
 
 		 472 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  30.57 
 
 		 476 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  27.72 
 
 		 523 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  26.8 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  30.77 
 
 		 496 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.77 
 
 		 503 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.77 
 
 		 503 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  26.83 
 
 		 474 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  30.77 
 
 		 496 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  31.67 
 
 		 518 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  30.11 
 
 		 397 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  30.11 
 
 		 527 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  31.14 
 
 		 501 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  30.11 
 
 		 527 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  30.69 
 
 		 525 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  26.91 
 
 		 466 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  28.52 
 
 		 484 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  29.89 
 
 		 496 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  30.74 
 
 		 477 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  29.82 
 
 		 462 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  29.63 
 
 		 492 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  30.29 
 
 		 478 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  29.12 
 
 		 446 aa  90.5  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  30.37 
 
 		 525 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  29.26 
 
 		 469 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  32 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  31.01 
 
 		 504 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  27.68 
 
 		 457 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  29.5 
 
 		 485 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  29.63 
 
 		 477 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  28.35 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  29.63 
 
 		 477 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  29.26 
 
 		 474 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  29.26 
 
 		 474 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  28.88 
 
 		 511 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  28.35 
 
 		 474 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.94 
 
 		 423 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  28.15 
 
 		 508 aa  89  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  26.84 
 
 		 361 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  28.96 
 
 		 478 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  28.96 
 
 		 475 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>