More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3766 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3766  Serine protease  100 
 
 		 288 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  58.95 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1717  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.1 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1880  PDZ/DHR/GLGF  44.21 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1031  PDZ/DHR/GLGF  42.81 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  33.89 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.93 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.56 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.53 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.31 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.12 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  29.78 
 
 		 527 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  33.71 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  27.92 
 
 		 464 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.34 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  29.09 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  29.56 
 
 		 508 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  26.27 
 
 		 355 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  29.04 
 
 		 528 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  30.12 
 
 		 504 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  28.47 
 
 		 482 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  26.35 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  28.31 
 
 		 528 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  28.31 
 
 		 526 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  30 
 
 		 520 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.24 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.04 
 
 		 503 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.04 
 
 		 503 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.79 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  27.34 
 
 		 497 aa  94  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.58 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  26.52 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  29.3 
 
 		 496 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0099  protease DegS  24.2 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  28.94 
 
 		 501 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  28.01 
 
 		 485 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  29.3 
 
 		 496 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  23.92 
 
 		 354 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.74 
 
 		 365 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  25.16 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.3 
 
 		 516 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  28.89 
 
 		 506 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  29.32 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  27.53 
 
 		 514 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  26.16 
 
 		 464 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  26.95 
 
 		 457 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  27.27 
 
 		 491 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  27.01 
 
 		 479 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  27.3 
 
 		 372 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  27.44 
 
 		 471 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  27.04 
 
 		 523 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.37 
 
 		 458 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  30.04 
 
 		 525 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  29.33 
 
 		 471 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  24.92 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  27.5 
 
 		 517 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  30.14 
 
 		 511 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  25.76 
 
 		 442 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  28.57 
 
 		 496 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  28.42 
 
 		 511 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  23.84 
 
 		 354 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  26.69 
 
 		 527 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  26.43 
 
 		 527 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  28.42 
 
 		 511 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  25.59 
 
 		 468 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  30.29 
 
 		 535 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  27.8 
 
 		 480 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  26.77 
 
 		 485 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  27.84 
 
 		 473 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  26.35 
 
 		 477 aa  85.9  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  26.35 
 
 		 477 aa  85.9  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  28.21 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  26.2 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  28.21 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  26.78 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  23.96 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  26.33 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  28.87 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  25.91 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  26.28 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  25.91 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  25.08 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.17 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  24.28 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  26.22 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  29.49 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  25.08 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  27.3 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  25.08 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  25.91 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  28.08 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  27.05 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0295  serine endoprotease  24.33 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  28.12 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  28.47 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  26.46 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  25.55 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.74 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  27.7 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>