More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0474 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0474  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 290 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1717  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  79.66 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3766  Serine protease  59.93 
 
 		 288 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.972329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1880  PDZ/DHR/GLGF  43.97 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1031  PDZ/DHR/GLGF  42.55 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3073  PDZ/DHR/GLGF  37.5 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.82446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0856  PDZ/DHR/GLGF  41.09 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0384143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  32.01 
 
 		 528 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0797  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.68 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 526 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.62 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  32.76 
 
 		 407 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0905  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1230  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.89 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.181134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  32.23 
 
 		 537 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  31.46 
 
 		 528 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  31.72 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  30.8 
 
 		 491 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  31.09 
 
 		 527 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0913  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.9 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000218264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  30.32 
 
 		 516 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  31.46 
 
 		 523 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.09 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  33.83 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.09 
 
 		 483 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  28.8 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  29.41 
 
 		 497 aa  107  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  30.36 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.51 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  30.34 
 
 		 520 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.44 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  29.27 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  31.7 
 
 		 527 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  30.97 
 
 		 504 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.25 
 
 		 338 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  31.25 
 
 		 395 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  31.87 
 
 		 496 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  30.13 
 
 		 514 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  27.07 
 
 		 355 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  32.58 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  30.48 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  30.47 
 
 		 508 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  31.75 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  31.75 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  30.69 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  31.48 
 
 		 501 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  28.48 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.74 
 
 		 503 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  32.14 
 
 		 476 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  31.87 
 
 		 496 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.74 
 
 		 503 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.8 
 
 		 412 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 		 525 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  31.5 
 
 		 496 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.57 
 
 		 457 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  30.37 
 
 		 508 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  30.13 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  28.97 
 
 		 471 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  30.42 
 
 		 513 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  29.24 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  31.2 
 
 		 503 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  30.03 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.11 
 
 		 484 aa  99.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  26.75 
 
 		 354 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  29.3 
 
 		 525 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30.71 
 
 		 458 aa  99.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  26.97 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  29.62 
 
 		 502 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  29.62 
 
 		 502 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  29.47 
 
 		 461 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  29.62 
 
 		 485 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  29.62 
 
 		 502 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  29.62 
 
 		 502 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  29.62 
 
 		 502 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  31.85 
 
 		 504 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  31.48 
 
 		 482 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30.53 
 
 		 511 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  30.11 
 
 		 520 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  31.17 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  28.88 
 
 		 499 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 		 523 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  29.48 
 
 		 506 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  28.88 
 
 		 499 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  30.6 
 
 		 511 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  31.02 
 
 		 485 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  29.82 
 
 		 462 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  30.37 
 
 		 479 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  29.49 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0554  PDZ/DHR/GLGF  29.01 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00992555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  29.63 
 
 		 474 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  31.77 
 
 		 474 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  28.88 
 
 		 498 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  26.89 
 
 		 354 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  28.11 
 
 		 476 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  28.88 
 
 		 498 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.15 
 
 		 351 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  28.88 
 
 		 498 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  27.27 
 
 		 504 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  24.21 
 
 		 354 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>