More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0740 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0740  diguanylate cyclase  100 
 
 		 706 aa  1357    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0441478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0853  diguanylate cyclase  34 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.59 
 
 		 675 aa  107  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.04 
 
 		 314 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 492 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 357 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0799  diguanylate cyclase  31.16 
 
 		 652 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1395  diguanylate cyclase  45.33 
 
 		 397 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0627  diguanylate cyclase  40.26 
 
 		 1052 aa  99.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.256226  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0392  putative signaling protein  40.14 
 
 		 558 aa  97.8  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1067  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 490 aa  98.2  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01755  predicted diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1856  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.4  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2010  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.446069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1872  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.320559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1405  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.856707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1846  diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 496 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0897436 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01743  hypothetical protein  31.01 
 
 		 496 aa  97.1  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  31.52 
 
 		 1826 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0069  diguanylate cyclase  34.25 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.222303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2510  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  31.01 
 
 		 496 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.291593  normal  0.751069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 539 aa  95.9  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.677434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  35.98 
 
 		 308 aa  95.1  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 548 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 593 aa  94.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  32.95 
 
 		 435 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 443 aa  94.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0542  diguanylate cyclase  37.75 
 
 		 285 aa  94.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 353 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  38.85 
 
 		 457 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1073  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 278 aa  93.6  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.41 
 
 		 464 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4377  GGDEF  32.97 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1153  diguanylate cyclase  29.45 
 
 		 299 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00439515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02671  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  34.44 
 
 		 531 aa  92.8  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 		 619 aa  93.2  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  38.56 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00408  sensory transduction protein kinase  36.96 
 
 		 264 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2355  hypothetical protein  34.23 
 
 		 293 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6048  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 506 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.423069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 578 aa  92  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0645  diguanylate cyclase  36.62 
 
 		 330 aa  91.7  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.669847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  39.87 
 
 		 457 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0346  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 570 aa  91.7  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0556  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 314 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1761  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 720 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0726  diguanylate cyclase  33.56 
 
 		 236 aa  91.3  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.914342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 372 aa  91.3  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 696 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.42 
 
 		 547 aa  91.3  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 555 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  43.94 
 
 		 457 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.12 
 
 		 1078 aa  90.9  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0698  diguanylate cyclase  38.56 
 
 		 388 aa  90.5  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814063  hitchhiker  0.00133482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  39.74 
 
 		 332 aa  90.5  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 538 aa  90.5  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  36.91 
 
 		 615 aa  90.5  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 498 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  38.96 
 
 		 462 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1150  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 547 aa  90.1  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6264  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 502 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.291677  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0413  diguanylate cyclase  34.39 
 
 		 342 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6431  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 502 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0676  diguanylate cyclase  38.56 
 
 		 388 aa  90.5  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1344  diguanylate cyclase  28.37 
 
 		 465 aa  90.1  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.549291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6666  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 502 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3392  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 406 aa  90.1  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 583 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0697  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 264 aa  89.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.184616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4315  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.25 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.554314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  40.28 
 
 		 386 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  44 
 
 		 455 aa  89.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  47.52 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.16 
 
 		 791 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  39.24 
 
 		 457 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2188  diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 362 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1834  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.4 
 
 		 571 aa  89.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1690  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 331 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.6 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5514  diguanylate cyclase  37.75 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0964  diguanylate cyclase  34.03 
 
 		 778 aa  89.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 419 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  38.16 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1694  diguanylate cyclase  34.27 
 
 		 431 aa  88.6  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 342 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 342 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  34.21 
 
 		 565 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3587  diguanylate cyclase  39.87 
 
 		 364 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.684884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.6 
 
 		 643 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  34.97 
 
 		 568 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 342 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0031  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 501 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0530472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0336  diguanylate cyclase  42.01 
 
 		 519 aa  88.6  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0386848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.6 
 
 		 643 aa  88.6  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.2 
 
 		 326 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1528  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 321 aa  88.6  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1443  diguanylate cyclase  35.86 
 
 		 376 aa  88.6  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000552485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03282  hypothetical FOG: GGDEF domain protein  37.21 
 
 		 712 aa  88.6  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>