182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0327 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 364 aa  714    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  67.78 
 
 		 368 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  65.92 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  65.46 
 
 		 385 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  64.71 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  60.72 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  59.94 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00351  Hydrogenase formation HypD protein  47.74 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0880  hydrogenase formation HypD protein  45.86 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  42.94 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.02 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.02 
 
 		 371 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  38.39 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.15 
 
 		 371 aa  265  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.24 
 
 		 382 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.71 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.51 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.41 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  38.89 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.56 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  39.53 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.62 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.37 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  41.04 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.88 
 
 		 342 aa  255  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.44 
 
 		 369 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.19 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.2 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.9 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  37.32 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.41 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  41.62 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.64 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  41.06 
 
 		 373 aa  252  9.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.64 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  40.48 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.27 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.5 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.27 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  42.15 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  37.9 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.18 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.3 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  40.52 
 
 		 361 aa  248  8e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.22 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.57 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.49 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  41.21 
 
 		 404 aa  246  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.47 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  34.47 
 
 		 365 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.23 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.82 
 
 		 378 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.24 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  40.35 
 
 		 363 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  41.44 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.59 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  41.5 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  39.65 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  38.62 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  39.65 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.39 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.33 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.28 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.12 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.76 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.74 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.76 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.36 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.35 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.39 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.9 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.83 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.83 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.26 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  39 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.48 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.12 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 380 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.14 
 
 		 371 aa  238  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.12 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.12 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.83 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.54 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.06 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.35 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>