183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0502 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 342 aa  705    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  75.37 
 
 		 342 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  74.25 
 
 		 341 aa  531  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  73.51 
 
 		 343 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  69.64 
 
 		 342 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.94 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.06 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.06 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.76 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.44 
 
 		 373 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  46.82 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  47.4 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.66 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.06 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.52 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  43.9 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  48.82 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.24 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  46.24 
 
 		 365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.62 
 
 		 393 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  46.29 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  46.36 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.31 
 
 		 364 aa  301  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.9 
 
 		 363 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  45.32 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.02 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.06 
 
 		 363 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.95 
 
 		 363 aa  296  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.35 
 
 		 377 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.39 
 
 		 362 aa  291  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  45.66 
 
 		 379 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.09 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.93 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.02 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.28 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.95 
 
 		 377 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.81 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.81 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.64 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.2 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.52 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  42.69 
 
 		 383 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.7 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  43.52 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.32 
 
 		 376 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.34 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 376 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  44.77 
 
 		 378 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  44.48 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  44.48 
 
 		 378 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  42.21 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.03 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  42.77 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.22 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.71 
 
 		 371 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  43.4 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.86 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.44 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.8 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.32 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.47 
 
 		 382 aa  276  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  45 
 
 		 371 aa  275  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.31 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.86 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.77 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.26 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.86 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 352 aa  272  7e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  44.12 
 
 		 375 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  40.92 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.06 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.09 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.61 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.73 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.73 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.32 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.73 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.92 
 
 		 375 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 362 aa  264  1e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.82 
 
 		 371 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.4 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.23 
 
 		 361 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  43.19 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.64 
 
 		 365 aa  261  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>