183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0389 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 346 aa  692    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.84 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  47.79 
 
 		 368 aa  332  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.67 
 
 		 362 aa  328  8e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.13 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  45.61 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.83 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.38 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  45.64 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  46.36 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.19 
 
 		 363 aa  311  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.68 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  43.93 
 
 		 383 aa  308  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.64 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.71 
 
 		 370 aa  305  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  43.55 
 
 		 365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.46 
 
 		 377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.95 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.03 
 
 		 384 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  43.77 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.75 
 
 		 361 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.76 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.62 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.56 
 
 		 371 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.28 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.27 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.29 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.24 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.29 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.5 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.86 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  46.04 
 
 		 375 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.43 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  42.07 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.22 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.22 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.95 
 
 		 380 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.61 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.53 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.88 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.36 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  43.1 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.1 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.1 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  43.1 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.1 
 
 		 386 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  43.18 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.1 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.89 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  41.71 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.43 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.19 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.09 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.21 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.84 
 
 		 378 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.52 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.07 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.52 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  41.26 
 
 		 379 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  42 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  42.77 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.89 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.18 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.17 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.29 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.92 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.97 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.41 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.68 
 
 		 373 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.03 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.06 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.7 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  42.25 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.23 
 
 		 355 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.69 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.28 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  40.7 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  42.65 
 
 		 375 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.45 
 
 		 376 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.63 
 
 		 366 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.62 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.76 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.4 
 
 		 362 aa  275  9e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.32 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.83 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.48 
 
 		 360 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>