182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3014 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 349 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  67.05 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  43.77 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.21 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.71 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.31 
 
 		 373 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.57 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  43.64 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 367 aa  288  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.57 
 
 		 365 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  41.38 
 
 		 383 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.62 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.71 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  41.12 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  42.64 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.81 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  44.61 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.57 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.26 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.57 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.68 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.47 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.76 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.26 
 
 		 363 aa  275  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.37 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.97 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.03 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.08 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.53 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  39.09 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.57 
 
 		 371 aa  271  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.32 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  39.08 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.38 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1092  hydrogenase formation HypD protein  43.64 
 
 		 351 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.55 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.38 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.86 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 371 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 373 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 373 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.51 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.28 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.02 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.35 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.62 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  41.64 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.04 
 
 		 371 aa  265  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.88 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.61 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.47 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.47 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  39.4 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.88 
 
 		 363 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.18 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.13 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  39.37 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  39.3 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.41 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  38.12 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.38 
 
 		 372 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.84 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  36.96 
 
 		 382 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.46 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.88 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.63 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.84 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.81 
 
 		 378 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.36 
 
 		 373 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.44 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  39.34 
 
 		 364 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.83 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.84 
 
 		 373 aa  255  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1615  hydrogenase formation HypD protein  39.78 
 
 		 411 aa  255  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.12 
 
 		 366 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.11 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.78 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.92 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.86 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.62 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>