184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1428 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 380 aa  784    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.57 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.42 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.02 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.17 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.2 
 
 		 375 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.29 
 
 		 379 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.29 
 
 		 371 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.29 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.02 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.03 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.03 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.71 
 
 		 372 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.49 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.75 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.49 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  56 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.5 
 
 		 362 aa  430  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.28 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.91 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.89 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.62 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.89 
 
 		 363 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.08 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.43 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.13 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.07 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.19 
 
 		 382 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  48.38 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.11 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  47.58 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.11 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.65 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.11 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.79 
 
 		 380 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.18 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.51 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  46.11 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.33 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.11 
 
 		 379 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.38 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.24 
 
 		 381 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  46.63 
 
 		 380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.9 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  46.63 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.89 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  43.01 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.72 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.45 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.85 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.85 
 
 		 381 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.64 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.01 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.65 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.38 
 
 		 376 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.74 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  43.05 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 371 aa  349  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.47 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.36 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.47 
 
 		 373 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.13 
 
 		 371 aa  348  9e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.14 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.67 
 
 		 379 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  44.47 
 
 		 363 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  44.2 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.93 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.82 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.58 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.09 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.55 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.98 
 
 		 373 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  42.67 
 
 		 379 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.55 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.4 
 
 		 380 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.92 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.25 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.13 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.5 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.2 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.94 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.21 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.71 
 
 		 374 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.63 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.01 
 
 		 362 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.05 
 
 		 378 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.29 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.21 
 
 		 371 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>