183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0789 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 363 aa  740    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  73.28 
 
 		 363 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  73.74 
 
 		 363 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  72.73 
 
 		 363 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  71.23 
 
 		 362 aa  545  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  70 
 
 		 362 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  70.67 
 
 		 362 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  69.55 
 
 		 361 aa  522  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  63.81 
 
 		 375 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.47 
 
 		 372 aa  434  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.65 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.92 
 
 		 375 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.08 
 
 		 379 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.08 
 
 		 379 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.63 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.2 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.77 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.42 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.37 
 
 		 379 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.65 
 
 		 379 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.82 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.92 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.82 
 
 		 379 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.55 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  52.43 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  47.51 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.37 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.28 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.81 
 
 		 382 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.82 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.85 
 
 		 369 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.69 
 
 		 368 aa  359  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  47.38 
 
 		 375 aa  358  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.97 
 
 		 380 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.47 
 
 		 378 aa  355  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.13 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.13 
 
 		 371 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.92 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.38 
 
 		 376 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.33 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  45.84 
 
 		 374 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  42.86 
 
 		 396 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  43.92 
 
 		 375 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.29 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.56 
 
 		 378 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 		 376 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.02 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.74 
 
 		 371 aa  345  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  45.31 
 
 		 380 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.51 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.21 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 367 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.58 
 
 		 371 aa  342  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.53 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.65 
 
 		 380 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.6 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.6 
 
 		 369 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 402 aa  341  9e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.33 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.37 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  44.23 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.74 
 
 		 362 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.25 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  43.21 
 
 		 362 aa  339  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.85 
 
 		 369 aa  338  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.46 
 
 		 371 aa  338  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.09 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.32 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.24 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.65 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.53 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.53 
 
 		 381 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.37 
 
 		 358 aa  335  9e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.67 
 
 		 376 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.09 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  40.44 
 
 		 382 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.17 
 
 		 385 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  42.74 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  41 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.43 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.56 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.11 
 
 		 368 aa  329  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.82 
 
 		 393 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.68 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 373 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 373 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>