183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3912 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 358 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  60.06 
 
 		 365 aa  475  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.82 
 
 		 369 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.91 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.91 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.37 
 
 		 369 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.07 
 
 		 371 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.23 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.4 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.38 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.4 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.35 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.79 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.79 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.79 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.51 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.35 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.79 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.35 
 
 		 364 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.68 
 
 		 367 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.47 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.56 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  51.12 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.72 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.96 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.96 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  51.96 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2386  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.5 
 
 		 367 aa  394  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0725223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.84 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.57 
 
 		 355 aa  371  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.91 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.27 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  48.07 
 
 		 383 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 		 376 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.26 
 
 		 382 aa  349  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 		 379 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.65 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.93 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.72 
 
 		 374 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  46.83 
 
 		 375 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  43.44 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.62 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.62 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.15 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.29 
 
 		 380 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 		 379 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  44.29 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.25 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.78 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.08 
 
 		 385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.24 
 
 		 379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.31 
 
 		 375 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.53 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.6 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  41.73 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 		 387 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.37 
 
 		 363 aa  335  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 362 aa  335  9e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  42.7 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.32 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.21 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.66 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.93 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  44.04 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.9 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.33 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.6 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.97 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.21 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.21 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 379 aa  327  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.35 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  43.9 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.66 
 
 		 379 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.21 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.72 
 
 		 373 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  43.49 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.93 
 
 		 379 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 379 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.08 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>