182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1401 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 355 aa  718    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.54 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.37 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.3 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.11 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.87 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.89 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.31 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.98 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.3 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.3 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.3 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.15 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.91 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.14 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  54 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.57 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.15 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.87 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.99 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.15 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  50 
 
 		 367 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.14 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.14 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.57 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  50 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  50.29 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  50.14 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2386  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.7 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0725223 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.14 
 
 		 363 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.74 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.31 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  45.04 
 
 		 383 aa  328  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.17 
 
 		 377 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.24 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.33 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.27 
 
 		 380 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.31 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.38 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.66 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  45.51 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.71 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.51 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.25 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.61 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 		 373 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.72 
 
 		 368 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  44.88 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  45.22 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.76 
 
 		 377 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.71 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.15 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  43.85 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  46.92 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.31 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.66 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.6 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.17 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  45.13 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.18 
 
 		 376 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  45.66 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.43 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.33 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.51 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.04 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  47.06 
 
 		 363 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.51 
 
 		 363 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.02 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.51 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.4 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  46 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.34 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.08 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.5 
 
 		 388 aa  299  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.85 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.22 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.49 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 379 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.49 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>