183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 370 aa  756    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  75.14 
 
 		 393 aa  562  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  72.27 
 
 		 359 aa  543  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.49 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  53.22 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.14 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.65 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.15 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.54 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.94 
 
 		 363 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.27 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.98 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  51.24 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.55 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.36 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.82 
 
 		 377 aa  363  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.58 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  47.38 
 
 		 383 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.3 
 
 		 382 aa  352  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  48.17 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.16 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.74 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.32 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.03 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.46 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  47.88 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.22 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.47 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.18 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  45.22 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.94 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.92 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  48.31 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.62 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.62 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.62 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.61 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.1 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.35 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.34 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.86 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 		 371 aa  332  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.24 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.35 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 		 380 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.15 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.68 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.06 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.59 
 
 		 379 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  43.82 
 
 		 365 aa  328  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.53 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.87 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.53 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  47.41 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  46.11 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.93 
 
 		 352 aa  325  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  44.84 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.41 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.68 
 
 		 388 aa  322  6e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.88 
 
 		 369 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.01 
 
 		 374 aa  322  8e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  46.05 
 
 		 374 aa  322  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.03 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.8 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.8 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.28 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.13 
 
 		 367 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.58 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.38 
 
 		 375 aa  319  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.66 
 
 		 378 aa  319  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  45.86 
 
 		 375 aa  318  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.66 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.14 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.23 
 
 		 379 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.71 
 
 		 368 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.71 
 
 		 368 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.6 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.04 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.06 
 
 		 372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.66 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.66 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.01 
 
 		 375 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.98 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.96 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.27 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.62 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  44.14 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.18 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.56 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.34 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.9 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.9 
 
 		 379 aa  305  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  43.71 
 
 		 346 aa  305  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>