183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2537 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 
368 aa  763    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  95.11 
 
 
368 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  62.97 
 
 
379 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  63.51 
 
 
380 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  61.62 
 
 
374 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  60.27 
 
 
380 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  60.49 
 
 
370 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  60.49 
 
 
370 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  62.06 
 
 
379 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  60.27 
 
 
378 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.46 
 
 
381 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.46 
 
 
376 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  57.38 
 
 
376 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.73 
 
 
387 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  58.63 
 
 
375 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  58.11 
 
 
380 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.03 
 
 
393 aa  454  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.83 
 
 
376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.01 
 
 
381 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  56.76 
 
 
380 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  55.43 
 
 
383 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.41 
 
 
377 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.2 
 
 
384 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.74 
 
 
382 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.4 
 
 
371 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.19 
 
 
376 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.92 
 
 
380 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  52.46 
 
 
375 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.89 
 
 
381 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.89 
 
 
381 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.02 
 
 
375 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.1 
 
 
378 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  49.87 
 
 
382 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.13 
 
 
377 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  49.73 
 
 
396 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.21 
 
 
385 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.32 
 
 
371 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.87 
 
 
379 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.12 
 
 
374 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 
375 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  49.34 
 
 
379 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.07 
 
 
379 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.7 
 
 
371 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 
362 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.55 
 
 
388 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.27 
 
 
369 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.47 
 
 
378 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.9 
 
 
372 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.58 
 
 
386 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.48 
 
 
379 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.48 
 
 
379 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.04 
 
 
379 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.76 
 
 
379 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.63 
 
 
369 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.79 
 
 
389 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.35 
 
 
362 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 
366 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.55 
 
 
364 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.04 
 
 
366 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.53 
 
 
371 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.84 
 
 
364 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.93 
 
 
379 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.95 
 
 
361 aa  367  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 
373 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  47.33 
 
 
380 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.08 
 
 
371 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.53 
 
 
379 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.32 
 
 
363 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.25 
 
 
371 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.43 
 
 
375 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.44 
 
 
379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.17 
 
 
363 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.85 
 
 
379 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.85 
 
 
379 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
363 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.51 
 
 
365 aa  359  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.3 
 
 
371 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 
402 aa  359  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.34 
 
 
371 aa  359  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 
366 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 
366 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 
366 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.85 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.85 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.45 
 
 
368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.13 
 
 
363 aa  355  5.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.59 
 
 
371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.31 
 
 
375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.4 
 
 
369 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.4 
 
 
369 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.3 
 
 
367 aa  350  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.15 
 
 
367 aa  347  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.91 
 
 
367 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0306  hydrogenase formation HypD protein  46.05 
 
 
386 aa  346  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0125924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3046  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845766  hitchhiker  0.0038327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  44.9 
 
 
361 aa  344  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.05 
 
 
373 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
373 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.53 
 
 
364 aa  344  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
373 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0121533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>