182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0089 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 352 aa  706    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  49.28 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  49 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.28 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.09 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.09 
 
 		 359 aa  332  9e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.59 
 
 		 382 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  45.65 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  44.86 
 
 		 383 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.93 
 
 		 370 aa  325  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.79 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.67 
 
 		 393 aa  322  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.52 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 363 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.68 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.36 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  42.36 
 
 		 363 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.3 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.24 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.55 
 
 		 376 aa  316  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.71 
 
 		 384 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.35 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  41.88 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.74 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  41.6 
 
 		 382 aa  309  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 375 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.75 
 
 		 375 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  40.79 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  44.99 
 
 		 368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  42.61 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.49 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.73 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.15 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  44.03 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 371 aa  305  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.05 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.15 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.15 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.41 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.41 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.74 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.88 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.35 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.46 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.77 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.82 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  41.43 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.69 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.67 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.15 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.43 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.35 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.29 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.18 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.29 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.95 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.18 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.6 
 
 		 377 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.62 
 
 		 379 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  42.57 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  45.24 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.33 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.71 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.18 
 
 		 373 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.05 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  39.33 
 
 		 379 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.09 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.73 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 388 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.98 
 
 		 379 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.23 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.23 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  43.77 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.75 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  39.6 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  40.67 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.33 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  41.45 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.75 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.42 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.86 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>