183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03910 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 365 aa  743    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  50 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.66 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.75 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.65 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.03 
 
 		 363 aa  358  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  46.39 
 
 		 363 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.41 
 
 		 363 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.2 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  46.96 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 		 384 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.76 
 
 		 363 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.81 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  48.62 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.98 
 
 		 382 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.5 
 
 		 376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.28 
 
 		 377 aa  338  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.48 
 
 		 363 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.13 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  44.35 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.86 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  43.5 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.96 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.02 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.82 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.93 
 
 		 374 aa  328  9e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.11 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.4 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  42.66 
 
 		 375 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.2 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.77 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.91 
 
 		 393 aa  323  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.49 
 
 		 380 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.98 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.21 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.56 
 
 		 364 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.71 
 
 		 375 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.87 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  41.85 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  41.19 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.29 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.62 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.24 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.73 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.73 
 
 		 369 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  44.17 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.41 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.98 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.23 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.98 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.24 
 
 		 364 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.58 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.63 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.5 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  46.36 
 
 		 346 aa  312  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.51 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.76 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.86 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  45.24 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.29 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.76 
 
 		 373 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.45 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 364 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.94 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.5 
 
 		 402 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.03 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.44 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  44.31 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.69 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.44 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  41.49 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.96 
 
 		 375 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  42.03 
 
 		 375 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  42.62 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.66 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.3 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.08 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.09 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  46.63 
 
 		 372 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.42 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.34 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.34 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.79 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.3 
 
 		 379 aa  296  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  40.76 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.76 
 
 		 376 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.58 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>