183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2007 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 
368 aa  745    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  63.04 
 
 
373 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  62.8 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.25 
 
 
363 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  52.59 
 
 
363 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.24 
 
 
370 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.55 
 
 
360 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.39 
 
 
363 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.85 
 
 
363 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.45 
 
 
359 aa  365  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.93 
 
 
363 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.5 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.77 
 
 
363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.86 
 
 
367 aa  358  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  48.62 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.28 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 
384 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.36 
 
 
364 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.59 
 
 
360 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  49.04 
 
 
365 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 
364 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  50.72 
 
 
365 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.95 
 
 
365 aa  349  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.87 
 
 
363 aa  348  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  48.09 
 
 
364 aa  348  9e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.91 
 
 
376 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 
362 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.64 
 
 
371 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  49.59 
 
 
363 aa  342  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.47 
 
 
367 aa  339  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.68 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  47.79 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.47 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.78 
 
 
371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.8 
 
 
371 aa  335  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  45.82 
 
 
396 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.83 
 
 
380 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 
382 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.2 
 
 
364 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.55 
 
 
375 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.14 
 
 
368 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.99 
 
 
364 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  45.36 
 
 
382 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.65 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  45.26 
 
 
362 aa  325  8.000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 
364 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 
378 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  42.93 
 
 
383 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  45.11 
 
 
375 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.05 
 
 
379 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.14 
 
 
366 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.14 
 
 
366 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.32 
 
 
379 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 
381 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 
381 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.14 
 
 
366 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.26 
 
 
371 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.95 
 
 
380 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.41 
 
 
373 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.99 
 
 
352 aa  315  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  43.78 
 
 
379 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  45.07 
 
 
374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.01 
 
 
371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.69 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.73 
 
 
379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.5 
 
 
369 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.99 
 
 
385 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.17 
 
 
368 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.4 
 
 
379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.59 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.94 
 
 
342 aa  306  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.93 
 
 
369 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.37 
 
 
358 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.93 
 
 
369 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  42.19 
 
 
361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.86 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.38 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  44.27 
 
 
380 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  45.09 
 
 
342 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.58 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.65 
 
 
365 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.51 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.51 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.39 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.48 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 
381 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.47 
 
 
376 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 
386 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.85 
 
 
379 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.14 
 
 
402 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.31 
 
 
380 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.85 
 
 
371 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.39 
 
 
379 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>