183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00520 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 359 aa  737    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  78.77 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  72.27 
 
 		 370 aa  543  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  55.46 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.09 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.04 
 
 		 360 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.38 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.06 
 
 		 365 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.79 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.46 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.96 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.82 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.98 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.01 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.09 
 
 		 382 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  50.99 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  46.96 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  50.42 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.41 
 
 		 377 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.27 
 
 		 377 aa  361  8e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.32 
 
 		 362 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.19 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  49.45 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.92 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.3 
 
 		 363 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.77 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  46.63 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.68 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.35 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.62 
 
 		 376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.99 
 
 		 371 aa  350  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.45 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.93 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 379 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.37 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.3 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.21 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.21 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.37 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  48.03 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.21 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  47.81 
 
 		 379 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.49 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  44.38 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.49 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.55 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.09 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  46.34 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 378 aa  339  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  45.3 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.49 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.58 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.65 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.74 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.81 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.49 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.17 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.93 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.92 
 
 		 379 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  47.83 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.63 
 
 		 373 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.65 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  47.49 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  46.84 
 
 		 346 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.45 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.45 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.83 
 
 		 376 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.09 
 
 		 352 aa  332  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.69 
 
 		 385 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.65 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.98 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.2 
 
 		 378 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.85 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.41 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.85 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.1 
 
 		 387 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  45.65 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.66 
 
 		 361 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.35 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.66 
 
 		 362 aa  325  1e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.53 
 
 		 369 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.33 
 
 		 376 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.23 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 371 aa  322  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.88 
 
 		 369 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  45 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.38 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.69 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.93 
 
 		 364 aa  318  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.02 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.68 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.28 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 379 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  47.35 
 
 		 375 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.63 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>