183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4014 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 360 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.32 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.85 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.62 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.17 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.04 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.32 
 
 		 371 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.49 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.39 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.08 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  51.67 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.83 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  51.25 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.03 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.2 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  53.2 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  50 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  54.77 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  48.21 
 
 		 383 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  50.42 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.97 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.52 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.77 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.17 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 377 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.53 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.26 
 
 		 382 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.73 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.81 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.42 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.42 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.7 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.42 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  51.25 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.72 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.7 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  48.2 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.14 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  48.63 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.14 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.06 
 
 		 360 aa  364  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.2 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.31 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  48.37 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  49.31 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.51 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.51 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  50.14 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.98 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.72 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  47.3 
 
 		 396 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  48.62 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.09 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 		 402 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.36 
 
 		 371 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.5 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.03 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.75 
 
 		 365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.69 
 
 		 380 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.4 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.18 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.54 
 
 		 385 aa  349  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.69 
 
 		 368 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 374 aa  348  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.41 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.91 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  45.13 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.03 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.83 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.01 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  47.08 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.43 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  47.93 
 
 		 375 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.23 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.63 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.85 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.09 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  46.2 
 
 		 380 aa  338  7e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  47.81 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.2 
 
 		 381 aa  338  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  47.81 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.08 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.94 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.81 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>