183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1216 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  98.9 
 
 		 364 aa  741    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  96.7 
 
 		 364 aa  726    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  100 
 
 		 364 aa  748    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.95 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  50.69 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.28 
 
 		 352 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.11 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  50 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.27 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.96 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.87 
 
 		 373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.14 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.63 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.63 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.41 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.68 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.74 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.56 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.86 
 
 		 371 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.11 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  47.5 
 
 		 365 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.84 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.71 
 
 		 377 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  46.94 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.75 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  48.09 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.9 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.22 
 
 		 370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  50 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  43.87 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.24 
 
 		 367 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.15 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.98 
 
 		 382 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.43 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  44.32 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.11 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 365 aa  336  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  44 
 
 		 381 aa  336  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  44 
 
 		 381 aa  336  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.4 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.5 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  44.63 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.74 
 
 		 376 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.5 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  43.28 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.75 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.25 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.28 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.32 
 
 		 377 aa  332  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  45.28 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.23 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.74 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.72 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  42.9 
 
 		 375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.57 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.87 
 
 		 378 aa  328  8e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.59 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.54 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  44.15 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.69 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.01 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  45.71 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.61 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.27 
 
 		 379 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  44.27 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.45 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.28 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 371 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.26 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.33 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.49 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.37 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.49 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.68 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.78 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.59 
 
 		 387 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.45 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.32 
 
 		 376 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.45 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.7 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.74 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.01 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.93 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  43.29 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.09 
 
 		 378 aa  316  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.01 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.69 
 
 		 373 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  43.33 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.96 
 
 		 371 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.99 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.42 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.31 
 
 		 376 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.4 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.42 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>