183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2177 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 
377 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  63.47 
 
 
373 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  62.33 
 
 
368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  55.04 
 
 
360 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.68 
 
 
359 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.55 
 
 
370 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.41 
 
 
363 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.14 
 
 
363 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  51.63 
 
 
393 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 
363 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  49.86 
 
 
363 aa  358  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.96 
 
 
364 aa  355  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.07 
 
 
367 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.96 
 
 
364 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  50 
 
 
364 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.2 
 
 
384 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.86 
 
 
362 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.88 
 
 
361 aa  348  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.49 
 
 
360 aa  345  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.31 
 
 
377 aa  343  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.9 
 
 
363 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.05 
 
 
363 aa  339  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.97 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  49.05 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.79 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.85 
 
 
375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.13 
 
 
382 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.53 
 
 
371 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  47.66 
 
 
365 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  48.41 
 
 
346 aa  330  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  45.8 
 
 
382 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  43.2 
 
 
383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  48.56 
 
 
365 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  45.24 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.11 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.04 
 
 
376 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  44.14 
 
 
365 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.58 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  46.51 
 
 
375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.85 
 
 
365 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.88 
 
 
373 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.95 
 
 
379 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.72 
 
 
369 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.92 
 
 
380 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.62 
 
 
371 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  45.82 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.41 
 
 
379 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.17 
 
 
380 aa  318  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.14 
 
 
376 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.97 
 
 
371 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.32 
 
 
371 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.16 
 
 
366 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.16 
 
 
366 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.16 
 
 
366 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.09 
 
 
371 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.45 
 
 
368 aa  315  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.96 
 
 
389 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.04 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.8 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  43.86 
 
 
374 aa  312  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.99 
 
 
385 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.91 
 
 
379 aa  312  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.3 
 
 
352 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.82 
 
 
371 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  49 
 
 
364 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 
367 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 
364 aa  310  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.84 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.51 
 
 
362 aa  309  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.92 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.55 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.67 
 
 
364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.92 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.38 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.38 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.34 
 
 
379 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.65 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.86 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.86 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 
376 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.89 
 
 
367 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 
378 aa  302  5.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  43.24 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.19 
 
 
362 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.95 
 
 
381 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 
373 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.4 
 
 
402 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.02 
 
 
373 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.09 
 
 
381 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.36 
 
 
366 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  41.69 
 
 
361 aa  299  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.43 
 
 
355 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  45.58 
 
 
375 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>