182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1275 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 368 aa  746    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  75.49 
 
 		 365 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  70.52 
 
 		 385 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  65.47 
 
 		 379 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  63.43 
 
 		 366 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  67.78 
 
 		 364 aa  471  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  63.71 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00351  Hydrogenase formation HypD protein  50.99 
 
 		 377 aa  355  8.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0880  hydrogenase formation HypD protein  43.3 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  43.82 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  42.13 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  38.82 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.62 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  39.3 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.99 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.18 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.06 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  38.06 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.78 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.29 
 
 		 363 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  38.7 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.31 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.2 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.57 
 
 		 382 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.74 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  38.23 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.74 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.39 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.86 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  40.17 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.86 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.95 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.38 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.39 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  36.75 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.67 
 
 		 371 aa  245  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.53 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  39.12 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.38 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.35 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.66 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.18 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.94 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.64 
 
 		 360 aa  242  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  40 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  39.95 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.58 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  41.4 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  38.63 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  38.54 
 
 		 404 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.35 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.18 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.3 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  39.55 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.57 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.37 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.95 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  40.23 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.26 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.24 
 
 		 379 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.9 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.39 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.39 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  38.61 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.98 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.26 
 
 		 363 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.6 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.33 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.33 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.55 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.72 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.31 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  40.17 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.72 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.73 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.05 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.94 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.94 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  38.74 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  40.17 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.66 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.85 
 
 		 365 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.38 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  36.67 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 373 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.99 
 
 		 378 aa  232  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  37.7 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.92 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  38.87 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.54 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.75 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.75 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.34 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.67 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.34 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>