185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1301 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 342 aa  703    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  82.46 
 
 		 343 aa  591  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  78.82 
 
 		 341 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  75.37 
 
 		 342 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  72.51 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.29 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.41 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.41 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.12 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.57 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.96 
 
 		 361 aa  318  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  45.98 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.88 
 
 		 360 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  46.47 
 
 		 372 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.32 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.64 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  45.98 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  43.91 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  45.32 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.8 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.22 
 
 		 363 aa  296  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.87 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  43.23 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.51 
 
 		 362 aa  295  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.64 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  43.7 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  44.71 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.36 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.25 
 
 		 367 aa  292  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.9 
 
 		 369 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  43.66 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.48 
 
 		 362 aa  292  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.26 
 
 		 379 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.3 
 
 		 377 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  44.81 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.95 
 
 		 364 aa  289  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  42.98 
 
 		 383 aa  289  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  41.95 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  44.81 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.45 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.88 
 
 		 359 aa  288  6e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  43.36 
 
 		 365 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  44.81 
 
 		 378 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.95 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.1 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  44.09 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.96 
 
 		 376 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.22 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.46 
 
 		 380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  43.79 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.23 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.51 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.92 
 
 		 380 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.52 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.31 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.2 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.38 
 
 		 371 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.45 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.18 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.23 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.92 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.92 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.92 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.94 
 
 		 365 aa  279  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.6 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.6 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.39 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.98 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.9 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.33 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  42.17 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.55 
 
 		 367 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.49 
 
 		 382 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.77 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.86 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.33 
 
 		 402 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.28 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.42 
 
 		 393 aa  273  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.71 
 
 		 367 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  43.02 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.19 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  42 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.28 
 
 		 369 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.41 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  40.12 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.7 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  41.67 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.94 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.64 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.16 
 
 		 371 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.97 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.66 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  38.6 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  40.29 
 
 		 396 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.48 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.39 
 
 		 374 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>