183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0664 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  98.61 
 
 		 360 aa  732    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 360 aa  743    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  92.78 
 
 		 360 aa  696    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  98.33 
 
 		 360 aa  734    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  75.61 
 
 		 373 aa  565  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  52.06 
 
 		 342 aa  353  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  52.34 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.14 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.71 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.12 
 
 		 342 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  48.73 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  45.82 
 
 		 383 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.09 
 
 		 382 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.92 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.48 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.5 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.31 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  44.44 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.48 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.72 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  41 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  45.72 
 
 		 375 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.27 
 
 		 363 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.46 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  41.69 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.89 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.98 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.06 
 
 		 368 aa  295  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.99 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.99 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.44 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  42.37 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.35 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.82 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  40.88 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.69 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.28 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.13 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.11 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.54 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.72 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.01 
 
 		 376 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.54 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.02 
 
 		 358 aa  288  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.9 
 
 		 364 aa  288  8e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.54 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.69 
 
 		 379 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.9 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.62 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  41.34 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  42.86 
 
 		 365 aa  286  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.71 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.05 
 
 		 393 aa  285  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.34 
 
 		 371 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  41.5 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.5 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.33 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.9 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  41 
 
 		 375 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.11 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.86 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.44 
 
 		 370 aa  282  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.11 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.99 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.24 
 
 		 381 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  42.21 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.77 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.7 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 376 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.01 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  40.83 
 
 		 380 aa  279  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.95 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  42.7 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.49 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.69 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.56 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.49 
 
 		 379 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.34 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.49 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.74 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  38.57 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.71 
 
 		 378 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  39.72 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.22 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.21 
 
 		 379 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.85 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.23 
 
 		 372 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.82 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.13 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>