183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0474 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 378 aa  765    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  97.88 
 
 		 378 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  98.15 
 
 		 378 aa  755    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  84.39 
 
 		 379 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  57.1 
 
 		 373 aa  431  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.7 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  45.45 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.76 
 
 		 341 aa  311  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.48 
 
 		 342 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.26 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  40.62 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  42.18 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.61 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.13 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.39 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  42.29 
 
 		 374 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  38.19 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.32 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.79 
 
 		 360 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.49 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.84 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.84 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.96 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.22 
 
 		 379 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.88 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.43 
 
 		 376 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  40.43 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.5 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.82 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 363 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.68 
 
 		 373 aa  268  8e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.73 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  39.78 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  37.43 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.95 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.46 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.33 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.23 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.29 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.05 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  40.55 
 
 		 363 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.78 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.29 
 
 		 375 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.58 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  42.62 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.05 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.21 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.19 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.84 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.66 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.16 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.25 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.51 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.27 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.63 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  38.38 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  38.19 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.38 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.34 
 
 		 363 aa  262  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.33 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.9 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  37.74 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.01 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.25 
 
 		 371 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  36.29 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2386  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.77 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0725223 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.29 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.36 
 
 		 362 aa  258  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.71 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.53 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.6 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.5 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.5 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  41.02 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  40.22 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.5 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.32 
 
 		 382 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.65 
 
 		 381 aa  255  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.12 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.42 
 
 		 367 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  41.44 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.9 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.32 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.99 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.99 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.97 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 379 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.99 
 
 		 379 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.08 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.32 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.5 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.35 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.71 
 
 		 362 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>