183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0930 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 375 aa  779    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.58 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.79 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.72 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.23 
 
 		 360 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  41.88 
 
 		 373 aa  292  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.65 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.7 
 
 		 382 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  42.69 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  38.14 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  39.33 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.66 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  40.34 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.72 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.83 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  40.9 
 
 		 378 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.35 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  40.62 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.92 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1615  hydrogenase formation HypD protein  40.31 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.48 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  40.98 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.14 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.24 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  40.34 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.64 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.81 
 
 		 363 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.99 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.94 
 
 		 368 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.92 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.6 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.99 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.19 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  40.81 
 
 		 403 aa  263  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.76 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  39.42 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  38.12 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  39.25 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.5 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  40.12 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.35 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  37.33 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.07 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.46 
 
 		 389 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.33 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.33 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  38.27 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.19 
 
 		 386 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.23 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.33 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  35.52 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.83 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.96 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.78 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.59 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.12 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.7 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.43 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.29 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.14 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.02 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.01 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.1 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.23 
 
 		 371 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.72 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.72 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.83 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  38.92 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.66 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.91 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.94 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.66 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.44 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.66 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.27 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.78 
 
 		 374 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.61 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  39.15 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.11 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.12 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.83 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.46 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.83 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2386  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.3 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0725223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.61 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.84 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  38.4 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.01 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.56 
 
 		 379 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.91 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.7 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.71 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.91 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.81 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.41 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.61 
 
 		 378 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.41 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>