183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2332 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 373 aa  753    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  58.31 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  57.65 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  57.92 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  57.1 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  47.09 
 
 		 342 aa  338  9e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.68 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.43 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.98 
 
 		 342 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.89 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.42 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.42 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.46 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.29 
 
 		 342 aa  315  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  44.47 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  41.55 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  40.78 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.26 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.58 
 
 		 371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.23 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  41.88 
 
 		 375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.72 
 
 		 382 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.73 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 371 aa  299  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 371 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  42.35 
 
 		 382 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  41.5 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.31 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.74 
 
 		 373 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.83 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.55 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.21 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.78 
 
 		 362 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.39 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.39 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  40.56 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.83 
 
 		 375 aa  292  7e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.34 
 
 		 369 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.06 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.22 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.5 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.06 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.29 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.25 
 
 		 376 aa  289  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.61 
 
 		 367 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.39 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.34 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  39.78 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.16 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.5 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.61 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.02 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.34 
 
 		 364 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.61 
 
 		 379 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.27 
 
 		 366 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.88 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  39.68 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.23 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.71 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.34 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.97 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.87 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  39.68 
 
 		 374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  42.82 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.53 
 
 		 374 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.29 
 
 		 364 aa  282  7.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  41.48 
 
 		 368 aa  282  7.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.71 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.11 
 
 		 364 aa  282  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.44 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  40.83 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.34 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.78 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.16 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.16 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.12 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.12 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.61 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.61 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.23 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.7 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 369 aa  278  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.34 
 
 		 379 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  41.26 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.5 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  38.54 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.29 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.44 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.56 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.9 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.88 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>