182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2487 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 360 aa  731    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  63.71 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  61.92 
 
 		 365 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  60.88 
 
 		 385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  59.44 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.89 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  59.94 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00351  Hydrogenase formation HypD protein  49.85 
 
 		 377 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0880  hydrogenase formation HypD protein  43.85 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  41.92 
 
 		 342 aa  269  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.16 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.16 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.74 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.37 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.24 
 
 		 376 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  41.91 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.9 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  37.5 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.96 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.29 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.67 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.35 
 
 		 359 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  35.67 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  38.96 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.18 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.88 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.5 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  38.38 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  38.7 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.29 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.21 
 
 		 382 aa  249  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.69 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.58 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.94 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  40.64 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.19 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.72 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 366 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.79 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.15 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.15 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.55 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.44 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.36 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.87 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.64 
 
 		 371 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  36.62 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.32 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.7 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  34.3 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.6 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.71 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.08 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.53 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.24 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  40.06 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  39.44 
 
 		 375 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.18 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.53 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  39.71 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.81 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.81 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.69 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  37.61 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  37.01 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  38.44 
 
 		 363 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.46 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.53 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  39.15 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.6 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.99 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.99 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  41 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.36 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  37.08 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.26 
 
 		 371 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.36 
 
 		 402 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.39 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  38.76 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.26 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.26 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.07 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.38 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.78 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.46 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02579  HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0960  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.926062  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02544  hypothetical protein  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2854  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.422409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  34.76 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3148  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0983  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2866  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3017  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.98 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>