183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1566 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 394 aa  803    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  70.85 
 
 		 403 aa  590  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  69.62 
 
 		 404 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  70.13 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1615  hydrogenase formation HypD protein  64.45 
 
 		 411 aa  549  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.8 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  44.01 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.7 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.46 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.73 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.6 
 
 		 360 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.6 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.33 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  41.03 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.6 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.37 
 
 		 363 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.63 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.55 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.28 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  40.12 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.5 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  41.4 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.5 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.44 
 
 		 341 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  37.5 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.97 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  41.71 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.62 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.24 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.03 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.05 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.85 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.61 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.55 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.37 
 
 		 373 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.87 
 
 		 342 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  40.78 
 
 		 385 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.54 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.13 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.67 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.93 
 
 		 382 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.48 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.48 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  39.01 
 
 		 380 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  39.88 
 
 		 342 aa  249  7e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.37 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  39.47 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.55 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  42 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  40.58 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  40.79 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  39.21 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.11 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  40.06 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.87 
 
 		 342 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.42 
 
 		 360 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.41 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.28 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  40.88 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.12 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.79 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.99 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.66 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  39.4 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  37.99 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.46 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.9 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  39.49 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.09 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  39.71 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.62 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  41.91 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.48 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.25 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.4 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.6 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.28 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  38.79 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.31 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.28 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.89 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.48 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.48 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.28 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  37.7 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  36.89 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.53 
 
 		 343 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  40.23 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  40.96 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.72 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.22 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  36.2 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.72 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>