182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0174 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 379 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  65.47 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  65 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  63.09 
 
 		 385 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  59.44 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  64.71 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  59.22 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00351  Hydrogenase formation HypD protein  49.16 
 
 		 377 aa  338  9e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0880  hydrogenase formation HypD protein  41.67 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  38.76 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  39.73 
 
 		 372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  37.08 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.02 
 
 		 382 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.23 
 
 		 365 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.33 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.2 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  35.54 
 
 		 383 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.04 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.86 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.04 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.72 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3111  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.03 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.82 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  40.88 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0863  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.94 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.948564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0715  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.94 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.26 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.32 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  39.66 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.31 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  35.61 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.6 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.04 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.53 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.76 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.76 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.46 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.76 
 
 		 375 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  35.53 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.91 
 
 		 402 aa  242  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3823  hydrogenase expression/formation  38.94 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  0.0677682 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.24 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  38.89 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.65 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3362  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.71 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.203707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.54 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.54 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.54 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.67 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  36.15 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.25 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0509  hydrogenase isoenzyme formation protein HypD  41.83 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.20958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.18 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.75 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.97 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.68 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2160  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.83 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.04 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.57 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  39.15 
 
 		 365 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  38.23 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  35.31 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.07 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.83 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.13 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0873  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.8 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.28 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.28 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.94 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  37.25 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.71 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  39.04 
 
 		 365 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.67 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  37.5 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.52 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.9 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.87 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.43 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.67 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.42 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.54 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  38.08 
 
 		 396 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.15 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3202  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.93 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.38 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.89 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.85 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2485  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.98 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  40.12 
 
 		 368 aa  232  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.99 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  37.11 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2386  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.57 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0725223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3010  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0121533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.88 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3167  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.54116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2979  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3062  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0891521 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.99 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>