182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0880 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0880  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 366 aa  756    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  41.81 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  45.86 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  43.3 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  43.85 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  41.67 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.3 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.17 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00351  Hydrogenase formation HypD protein  38.12 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  35.16 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.1 
 
 		 364 aa  215  9e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  34.3 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.26 
 
 		 379 aa  212  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.81 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  33.81 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1869  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.39 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.06 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.83 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1814  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.1 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2163  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.1 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.55 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.55 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.55 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  30.77 
 
 		 382 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.21 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.31 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  32.42 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  32.41 
 
 		 346 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.36 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.06 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.03 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  34.48 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.31 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  33.62 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  34.2 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.36 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.17 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.51 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.73 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.18 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  31.87 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.03 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  34.01 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1757  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.61 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.06 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  34.44 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.7 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.69 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.95 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.72 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.33 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.24 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  33.62 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.49 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  33.53 
 
 		 363 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  30.06 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  34.28 
 
 		 362 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.76 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.98 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.31 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  28.89 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.71 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  31.5 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.15 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.43 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.84 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.24 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  30.05 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.15 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.99 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.66 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.64 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  34.29 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.25 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.71 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.12 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  30.22 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  29.78 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.33 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  35 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  30.05 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.44 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.13 
 
 		 359 aa  189  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.15 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.01 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.68 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  33.82 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.91 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.18 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  32.15 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  31.4 
 
 		 365 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  29.29 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  33.43 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  34.11 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  33.52 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  32.77 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1615  hydrogenase formation HypD protein  31.59 
 
 		 411 aa  185  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  34.23 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  29.72 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  32.66 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>