183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0399 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0205  hydrogenase formation HypD protein  94.99 
 
 		 399 aa  796    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000749019  normal  0.0529868 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1287  hydrogenase formation HypD protein  80.85 
 
 		 403 aa  698    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.791611 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0399  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 404 aa  831    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.268739  normal  0.656819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1566  hydrogenase formation HypD protein  69.62 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1615  hydrogenase formation HypD protein  62.84 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.53 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.37 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.37 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.1 
 
 		 360 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.74 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.14 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  39.01 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  40.98 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.68 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  42.42 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  40.05 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.32 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.84 
 
 		 363 aa  259  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.62 
 
 		 352 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  42.57 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 365 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.43 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.8 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.48 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3014  hydrogenase formation HypD protein  39.84 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  40.82 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.15 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.42 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.5 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.45 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.11 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.73 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  39.79 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.96 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.86 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.93 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.52 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  37 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.74 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.73 
 
 		 370 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.73 
 
 		 370 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3912  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.26 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1740  hydrogenase formation HypD protein  38.34 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.4 
 
 		 342 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  39.09 
 
 		 365 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.02 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.46 
 
 		 367 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.53 
 
 		 371 aa  242  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  39.55 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.57 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.64 
 
 		 368 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  39.22 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.92 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  38.54 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1667  hydrogenase formation HypD protein  40.17 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  37.19 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.77 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.61 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  37.21 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  39.84 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.41 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.22 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.14 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  35.73 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.78 
 
 		 376 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.7 
 
 		 380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.04 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.75 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.44 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.57 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.79 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.96 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.36 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  38.11 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  37.97 
 
 		 380 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.68 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  38.2 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  41.21 
 
 		 364 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.39 
 
 		 388 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50450  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.82 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216438  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  39.83 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.33 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.63 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  35.71 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.43 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.43 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4588  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.78 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.27 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.12 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.39 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2186  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.03 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185739  normal  0.302113 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  40.23 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  39.94 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  38.84 
 
 		 360 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.49 
 
 		 378 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1834  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.4 
 
 		 379 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  36.27 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  39.66 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>