183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1207 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1207  hydrogenase formation HypD protein  100 
 
 		 372 aa  767    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  40.78 
 
 		 373 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  40.17 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3130  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.55 
 
 		 363 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1132  hydrogenase expression/formation protein HypD  41 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.44 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.22 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.6 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  40.6 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.6 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.44 
 
 		 371 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.39 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.06 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2041  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.64 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  43.37 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0866  hydrogenase expression/formation protein HypD  39 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0892  hydrogenase expression/formation protein HypD  39 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26538  normal  0.532572 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1094  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.12 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.06 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1891  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.4 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  39.44 
 
 		 365 aa  275  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0931  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.5 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.455246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1952  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.34 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.83 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  38.61 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1671  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.07 
 
 		 386 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  39.5 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  37.71 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1096  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.87 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.01 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.43 
 
 		 369 aa  272  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.99 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.86 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.05 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.15 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.85 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  38.38 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  40.77 
 
 		 368 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0537  hydrogenase formation protein HypD  35.9 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.25 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.09 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  37.6 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.39 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0789  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.91 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.633306  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0174  hydrogenase expression/formation protein  38.76 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.57 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1900  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.29 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00044285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  37.4 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.43 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.91 
 
 		 376 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.36 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1275  hydrogenase formation HypD protein  38.82 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2025  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.46 
 
 		 372 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.657636  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1264  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.44 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.91 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.87 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2438  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.56 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.841685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.87 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.29 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.46 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3981  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.81 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  38.12 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.94 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1913  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.84 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.11 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.69 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  38.06 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.46 
 
 		 402 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.71 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.99 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0049  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.91 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.185682  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.43 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2111  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.44 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.26 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1881  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.89 
 
 		 379 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.75 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.77 
 
 		 342 aa  258  9e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1603  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.64 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2091  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.64 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2487  hydrogenase formation HypD protein  37.5 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.74 
 
 		 371 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1163  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.27 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1428  hydrogenase formation HypD protein  35.95 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.719825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3751  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.67 
 
 		 385 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.24 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.71 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.19 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.71 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1906  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.62 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.51 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  37.91 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2741  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.54 
 
 		 381 aa  256  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2413  hydrogenase expression/formation protein HypD  35.99 
 
 		 379 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.430044  hitchhiker  0.000120097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0327  hydrogenase formation HypD protein  38.1 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0678838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  38.87 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  36.76 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>