More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4711 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 201 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.83 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.02 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.04 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.24 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  25.53 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
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NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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