More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1170 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  353  5.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 332 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  41.1 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  38.89 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>