138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13278 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 243 aa  318  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 235 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  72.12 
 
 		 274 aa  310  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 217 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 321 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.09 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.71 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.14 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  22.58 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  38.78 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>