More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  100 
 
 		 395 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  67.58 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  63.82 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  62.71 
 
 		 389 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  65.3 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  64.48 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  64.48 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  64.95 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  63.4 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  66.07 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  62.73 
 
 		 379 aa  349  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  58.2 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  58.4 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  60.68 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  57.22 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  57.55 
 
 		 383 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  53.55 
 
 		 387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  58.01 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  62 
 
 		 400 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  58.33 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  53.04 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  56.82 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  54.3 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  56.51 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.35 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  54.42 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  53.61 
 
 		 393 aa  272  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  58.28 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  51.14 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  54.13 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.27 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  41.99 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  41.74 
 
 		 445 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.34 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 442 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  53.57 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 492 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  41.19 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.27 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  36.77 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  38.99 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.14 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.75 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 462 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 480 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  38.01 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  42.34 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 482 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  43.89 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  38.01 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 490 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4393  type II secretion system protein E  43.03 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 451 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 451 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  41.89 
 
 		 450 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 455 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  41.49 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 476 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 488 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 482 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  43.03 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 484 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  42.95 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  43.89 
 
 		 469 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 418 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  40.51 
 
 		 455 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  41.79 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  41.79 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  41.79 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  36.8 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  37.42 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0646  type II secretion system protein E  45.58 
 
 		 423 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 491 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  40.19 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  38.92 
 
 		 492 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  40.24 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>