More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0651 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  58.84 
 
 		 1055 aa  1281    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  81.55 
 
 		 1073 aa  1832    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 		 1065 aa  873    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  45.97 
 
 		 1061 aa  974    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  43.9 
 
 		 840 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  80.04 
 
 		 1102 aa  1818    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  58.65 
 
 		 1056 aa  1291    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  45.32 
 
 		 1048 aa  890    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  62.1 
 
 		 1065 aa  1381    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 1067 aa  2196    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  63.05 
 
 		 1060 aa  1399    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  46.77 
 
 		 1054 aa  997    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  52.88 
 
 		 1004 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  53.79 
 
 		 961 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  51.85 
 
 		 796 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  47.89 
 
 		 968 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  50.83 
 
 		 938 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  51.34 
 
 		 962 aa  396  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  51.5 
 
 		 983 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  51.78 
 
 		 980 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  49.24 
 
 		 980 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  48.64 
 
 		 973 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  50.26 
 
 		 984 aa  386  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 		 984 aa  386  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  48.98 
 
 		 840 aa  355  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 		 940 aa  351  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  47.33 
 
 		 964 aa  349  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 746 aa  309  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  39.95 
 
 		 524 aa  267  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.9 
 
 		 540 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 		 542 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  37.6 
 
 		 796 aa  230  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  44.81 
 
 		 270 aa  210  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 576 aa  210  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  35.79 
 
 		 528 aa  207  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 568 aa  184  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 515 aa  181  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 539 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  57.38 
 
 		 711 aa  154  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 691 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  66.34 
 
 		 102 aa  144  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 		 686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 544 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 		 560 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 2654 aa  115  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.9 
 
 		 2213 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 1574 aa  108  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  26.21 
 
 		 2035 aa  101  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 1788 aa  99.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  22.9 
 
 		 935 aa  92.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 		 1214 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 		 1165 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 424 aa  87  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 1237 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.24 
 
 		 778 aa  85.9  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.27 
 
 		 1244 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.92 
 
 		 1251 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 726 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.97 
 
 		 775 aa  81.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.69 
 
 		 1194 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  21.4 
 
 		 923 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.72 
 
 		 760 aa  77.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1196 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.9 
 
 		 946 aa  77.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 703 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 		 1069 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 1410 aa  75.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 703 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.66 
 
 		 1248 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.46 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  24.15 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  24.54 
 
 		 1215 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 636 aa  74.7  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 932 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.32 
 
 		 589 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  19.01 
 
 		 1247 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  23.73 
 
 		 1206 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 268 aa  73.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  22.18 
 
 		 893 aa  73.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  36.22 
 
 		 384 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 654 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  24.17 
 
 		 934 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  23.14 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  24.51 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  24.07 
 
 		 830 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  23.65 
 
 		 932 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 422 aa  72  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.83 
 
 		 348 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5034  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.749308  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.57 
 
 		 1210 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1090 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  36.84 
 
 		 422 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 539 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2016  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 421 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>