138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6264  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.085092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  104  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1125  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  36.26 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 421 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  40.98 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  38.03 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  42.37 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 403 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 299 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 266 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>