More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2789 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 255 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  87.06 
 
 		 255 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  87.06 
 
 		 255 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  86.27 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  85.88 
 
 		 255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 255 aa  447  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  85.1 
 
 		 255 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  60.85 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 258 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  49.61 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  50.39 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  48.05 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  43.7 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.39 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 322 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.93 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.83 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  31.1 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  32.74 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  34.06 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.35 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  31.28 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.03 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 281 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  31.2 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>