More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1894 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  58 
 
 		 2479 aa  2424    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  49.47 
 
 		 2652 aa  1939    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  37.34 
 
 		 2534 aa  1409    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  57.65 
 
 		 2510 aa  2392    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  35.59 
 
 		 2558 aa  784    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  31.77 
 
 		 2698 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  34.32 
 
 		 2554 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  100 
 
 		 2443 aa  4981    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4343  insecticidal toxin protein, putative  31.38 
 
 		 1446 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4036  virulence B protein  31.2 
 
 		 1447 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1182  insecticidal toxin complex  31.12 
 
 		 1496 aa  502  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000603526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0175  YO185-like protein  29.51 
 
 		 1528 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0414  putative insecticidal toxin complex protein  30.99 
 
 		 1505 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0161  TcdB1  30.18 
 
 		 1485 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0478  virulence plasmid 65kDa B protein  30.88 
 
 		 1489 aa  490  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174725  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  31.7 
 
 		 2417 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  31.7 
 
 		 2458 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0608  virulence plasmid 65kDa B protein  29.46 
 
 		 1540 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0577  virulence plasmid 65kDa B protein  29.46 
 
 		 1540 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0602  virulence plasmid 65kDa B protein  29.46 
 
 		 1540 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.392707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4453  hypothetical protein  30.98 
 
 		 1488 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0993891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  30.2 
 
 		 1976 aa  350  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  28.08 
 
 		 2031 aa  280  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.08 
 
 		 2031 aa  279  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  28.13 
 
 		 2032 aa  276  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  33.43 
 
 		 952 aa  261  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  33.28 
 
 		 881 aa  261  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  31.56 
 
 		 940 aa  260  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  31.51 
 
 		 955 aa  259  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  31.96 
 
 		 886 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  31.27 
 
 		 921 aa  256  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  34.5 
 
 		 927 aa  255  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  34.28 
 
 		 989 aa  253  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  30.86 
 
 		 910 aa  252  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 2031 aa  250  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1806 aa  246  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1825 aa  246  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1825 aa  245  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  30.11 
 
 		 929 aa  244  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  31.7 
 
 		 939 aa  244  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  30.78 
 
 		 958 aa  243  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  32.38 
 
 		 920 aa  242  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  30.35 
 
 		 952 aa  241  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  30.49 
 
 		 952 aa  239  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  30.58 
 
 		 956 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  32.25 
 
 		 980 aa  219  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  31.87 
 
 		 923 aa  211  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 962 aa  208  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  31.49 
 
 		 962 aa  208  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  31.07 
 
 		 958 aa  208  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 852 aa  205  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  31.51 
 
 		 922 aa  205  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  30.88 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  30.88 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  30.88 
 
 		 954 aa  205  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  30.96 
 
 		 994 aa  203  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  27.26 
 
 		 2059 aa  187  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  27.08 
 
 		 2035 aa  182  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  29.24 
 
 		 891 aa  179  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  28.01 
 
 		 928 aa  171  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  29.29 
 
 		 942 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  28.07 
 
 		 944 aa  166  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1126 aa  153  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 3320 aa  150  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  28.48 
 
 		 893 aa  150  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1488 aa  144  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1140 aa  139  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  26.22 
 
 		 3456 aa  124  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2959  hypothetical protein  75.31 
 
 		 119 aa  124  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.650705 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1834 aa  114  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 690 aa  104  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.48 
 
 		 2096 aa  101  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.51 
 
 		 927 aa  101  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.5 
 
 		 2076 aa  97.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.48 
 
 		 2094 aa  96.3  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  26.76 
 
 		 1140 aa  95.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 628 aa  95.1  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1352 aa  93.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.77 
 
 		 1271 aa  89.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1433 aa  89.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1600 aa  89.4  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2612  hypothetical protein  75 
 
 		 103 aa  89  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  29.44 
 
 		 1338 aa  88.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.04 
 
 		 788 aa  87.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.04 
 
 		 788 aa  87.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.1 
 
 		 1953 aa  84.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 605 aa  84  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1595 aa  83.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  27.76 
 
 		 2349 aa  82.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  27.52 
 
 		 2658 aa  82.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.2 
 
 		 1586 aa  82.4  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1753 aa  82  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1517 aa  81.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1959 aa  79.7  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.32 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 2003 aa  79.7  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.12 
 
 		 2035 aa  79.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1602 aa  79.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.89 
 
 		 1679 aa  79  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>