130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1046 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1043  extracellular solute-binding protein family 1  72.54 
 
 		 435 aa  656    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1046  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  880    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  40.09 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  38.85 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.34 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.8 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.21 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 432 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.6 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.85 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.4 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.58 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.4 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  31.39 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.18 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.46 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.27 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.36 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.83 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.86 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.83 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.81 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  35.9 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.67 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2195  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21890  hypothetical protein  23.62 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0276  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00588273  hitchhiker  0.000015311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.39 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.66 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.55 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>