More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4711 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  100 
 
 		 219 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  69.86 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.93 
 
 		 980 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.5 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  38.3 
 
 		 280 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  37.94 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.48 
 
 		 2105 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.53 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.92 
 
 		 1795 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.6 
 
 		 615 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.82 
 
 		 686 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  45.67 
 
 		 460 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.45 
 
 		 2668 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.13 
 
 		 526 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.88 
 
 		 2885 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.04 
 
 		 1424 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.06 
 
 		 1236 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.37 
 
 		 2667 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  42.86 
 
 		 757 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.09 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.12 
 
 		 1016 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  35.68 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  45.99 
 
 		 1712 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 		 341 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  41.23 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.24 
 
 		 1279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 		 363 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.35 
 
 		 421 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.49 
 
 		 485 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  48.98 
 
 		 491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.34 
 
 		 3619 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  45.81 
 
 		 2775 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.89 
 
 		 3619 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  52.55 
 
 		 946 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45.86 
 
 		 1164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.4 
 
 		 3427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  44.2 
 
 		 561 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  46.5 
 
 		 3954 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  40.39 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  47.97 
 
 		 595 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.89 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.03 
 
 		 1883 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.83 
 
 		 5171 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 		 9867 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  43.4 
 
 		 938 aa  105  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 		 1079 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 4334 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  47.55 
 
 		 795 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  48.32 
 
 		 2954 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  42.62 
 
 		 424 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.62 
 
 		 813 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  49.63 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.03 
 
 		 1363 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 467 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  47.14 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 1895 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.09 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.62 
 
 		 1197 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 639 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  49.18 
 
 		 717 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 437 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  45.11 
 
 		 4798 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40 
 
 		 1499 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.34 
 
 		 588 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 		 724 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  41.12 
 
 		 393 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  48.92 
 
 		 582 aa  98.2  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  47.97 
 
 		 613 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  41.38 
 
 		 1287 aa  98.2  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.77 
 
 		 1963 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  43.8 
 
 		 744 aa  98.2  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  48.15 
 
 		 1306 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  36.74 
 
 		 1383 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  38.39 
 
 		 3608 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  48.2 
 
 		 585 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  45.58 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.28 
 
 		 1156 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.55 
 
 		 1400 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.62 
 
 		 679 aa  97.1  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.57 
 
 		 577 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  41.81 
 
 		 1814 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 		 1855 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.39 
 
 		 475 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.34 
 
 		 2678 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 257 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  39.38 
 
 		 556 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 		 1532 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  41.81 
 
 		 686 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  41.52 
 
 		 867 aa  94.4  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.36 
 
 		 1534 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  43.65 
 
 		 850 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  34.1 
 
 		 355 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  46.83 
 
 		 572 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  38.39 
 
 		 475 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  44 
 
 		 2107 aa  92.4  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 		 361 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>