271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3424 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  100 
 
 		 314 aa  610  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  66.13 
 
 		 315 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  66.13 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  62.94 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  40.78 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  35.99 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  32.9 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  32.57 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  32.57 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  32.88 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  32.34 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.68 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.25 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  31.1 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.54 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  30.98 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  30.98 
 
 		 318 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.07 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.07 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.31 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  31.21 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.56 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.74 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.03 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.79 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.68 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.05 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 372 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 342 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.1 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.12 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 362 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.65 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.03 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  31.38 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  25 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.16 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.99 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.08 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.54 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.78 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.08 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25.98 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  26.06 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  22.6 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  24.77 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>